Trong 10 năm qua, bệnh viện đã ghép thận cho 12 trẻ và thực hiện ghép gan cho 8 trẻ từ người cho sống. Ca ghép thận đầu tiên được thực hiện ngày 14-6-2004 cho cháu Huỳnh Nguyễn Nhật Trúc (12 tuổi ở tỉnh Gia Lai) với kíp phẫu thuật gồm 70 giáo sư, bác sĩ, chuyên viên Pháp - Việt. Người cho thận là mẹ của cháu Trúc. Sau ca mổ, cháu Nhật Trúc sức khỏe ổn định. Đây là ca ghép tạng tạo cơ sở ban đầu cho việc tiến tới ghép thận thường xuyên tại Bệnh viện Nhi đồng 2.

Sau những ca ghép thận thành công, bệnh viện triển khai tiếp ghép gan và ca ghép gan thứ 8 vừa diễn ra ngày 4-9 đã thành công, người cho gan là mẹ của bé cũng đã tỉnh táo. Đó là trường hợp bé Phan Nguyễn Minh H. (1 tuổi, ngụ quận 8, TPHCM), mắc bệnh teo đường mật và đã được mổ Kasai lúc được 3,5 tháng tại Bệnh viện Nhi đồng 2. Bé H. được chỉ định ghép gan vì xơ gan giai đoạn cuối, có biến chứng nhiễm trùng đường mật, viêm phổi, tăng áp tĩnh mạch cửa. Ca ghép gan kéo dài trong vòng 15 giờ với sự phối hợp của các bác sĩ Bệnh viện Saint Lue (Vương quốc Bỉ).

Theo thống kê, tại Việt Nam mỗi năm có khoảng 96 trường hợp teo đường mật bẩm sinh, trong đó phân nửa số trường hợp cần được ghép gan.