Phần lớn số tiền đầu tư các dự án BOT giao thông là từ vốn vay ngân hàng, nhà đầu tư chỉ góp vốn tự có từ 10 đến 20%. Số tiền vay từ ngân hàng đứng trước nguy cơ trở thành nợ xấu.